はい。可能です。
ご利用の独自SSLにより手順は異なります。

無料独自SSLの場合

サーバーパネル内「SSL設定」にて、設定済みの無料独自SSLの「削除」ボタンから削除(アンインストール)することができます。

オプション独自SSLの場合

スターアカウント内で以下の手続きを順に行うことにより、削除(アンインストール)することができます。

1. スターアカウントへログインし、対象サービスの契約管理ページからSSL証明書の契約一覧の該当SSL証明書の縦三点リーダーメニュー内「契約情報」より削除(アンインストール)が可能です。

※利用期限内のSSL証明書は、同一スターアカウントの他のサーバーアカウントにインストールを行い、引き続き利用することができます。
詳細は、よくある質問「発行したSSL証明書を他のサーバーアカウントで利用することはできますか？」をご参照ください。